蚌埠醫(yī)學院藥學院始建于2000年，2001年開始招收藥學專業(yè)本科生，2002年獲批藥理學專業(yè)碩士學位授權點，2008年被評為省級藥學特色專業(yè)建設點，2017年獲批藥學一級學科碩士學位授權點和藥學專業(yè)學位授權點?，F(xiàn)有藥學、藥物分析、臨床藥學3個專業(yè)，是安徽省藥學專業(yè)技術人員繼續(xù)教育基地和卓越藥學專業(yè)人才教育培養(yǎng)計劃建設項目單位。擁有國家藥物臨床試驗機構I期臨床研究室、安徽省生化藥物工程技術研究中心、藥學博士后崗位，2013年獲批安徽省生化藥物產(chǎn)業(yè)技術創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟理事長單位。2016年獲安徽省教學成果一等獎一項，2018年通過安徽省藥學專業(yè)綜合評估，2019年藥學專業(yè)獲批省級一流專業(yè)，2020年獲批校級一流學科。

藥學院下設藥理學、藥物化學、藥物分析、藥劑學、中醫(yī)藥基礎及臨床藥學6個教研室、藥學實驗中心、學生管理辦公室、學院辦公室?，F(xiàn)有教師60名，其中專任教師52人，教授、副教授30名，高級職稱占比57.7%，博士占比50%。多位教師分獲全國優(yōu)秀教師、省模范教師、省教學名師、省級教壇新秀、省特支計劃人才、省學術技術帶頭人后備人選及中國藥理學會施維雅青年藥理學家獎等榮譽稱號。

近五年承擔科研項目國家重大新藥創(chuàng)制項目1項、國家自然科學基金項目12項、安徽省科技重大專項1項、安徽省重點研究與開發(fā)項目1項及其他省部級以上項目共60余項；發(fā)表科研論文200余篇，其中SCI收錄 60余篇；主、參編教材、專著30余部。迄今已向社會成功輸送藥學專業(yè)本科畢業(yè)學生2126名，學術型碩士研究生163名。

 藥學院以立德樹人為根本任務，以“勘藥助醫(yī)、培智育才”為理念，為辦好人民滿意的醫(yī)藥學教育而不懈努力。