生物食品與環(huán)境學院是在生物與環(huán)境工程系基礎上設立的。前身生物與環(huán)境工程系是我院最早建設的工科系之一，也是與德國下薩克森州開展教育合作的重點系之一。1980年合肥學院前身之一合肥聯(lián)合大學建校時，首招兩個本科專業(yè)“應用微生物”和“環(huán)境監(jiān)測”；1985年組建“環(huán)境化學工程系”，逐步發(fā)展為“化學與生物工程系”、“生物與科學技術系”，2004年正式定名為“生物與環(huán)境工程系”。2019年設立為生物食品與環(huán)境學院?，F(xiàn)設有生物工程系、環(huán)境工程系、食品工程系3個系部。其中食品質(zhì)量與安全專業(yè)2014年首次招生；1個環(huán)境工程專業(yè)碩士學位點，自2012年起招生,研究生264人。

 生物食品與環(huán)境學院擁有較雄厚的師資力量，專任教師65人，其中教授12人，副教授14人，高級實驗師3人；具有副高以上職稱的教師占院專任教師比例為44.7%，40歲以下教師具有碩士學位達到100%。另有德國客座教授4人，國內(nèi)客座教授3人，中國科大返聘教授1人。教師中省級教學名師3人，安徽省高校學科帶頭人2人，安徽省高等學?？萍及渭馊瞬?/span>1人，省級優(yōu)秀中青年骨干教師2人，高等學校省級教壇新秀獎4人；此外，2人為中國微生物學會基礎微生物學專業(yè)委員會和酶工程專業(yè)委員會委員；4人為安徽省生物工程學會理事；1人為安徽省生化與分子學會副理事長、1人為安徽省微生物學會副理事長；1人為安徽省環(huán)境科學學會常務理事，1人分別為安徽省微生物學會和環(huán)境科學學會理事；4人為《生物學雜志》編委，其中1人為常務副主編。

 生物食品與環(huán)境學院下設3個系和1個實驗中心，擁有先進的實驗儀器設備和較為系統(tǒng)的研究條件。現(xiàn)31個專業(yè)基礎和專業(yè)實驗室、8個公共實驗室、6個教師科研平臺，總建筑面積5000m²。承擔我系四個本科專業(yè)和一個碩士專業(yè)的專業(yè)基礎和專業(yè)實驗課程，并為系部科研活動提供支撐。實驗室擁有眾多精密儀器及一般儀器3000多套，儀器總價值2500多萬元。實驗室擁有專職管理人員8人，其中高級實驗師3人。

 生物工程專業(yè)2004年成功申報為省級教改示范專業(yè)，2008年成功申報為國家特色專業(yè)，環(huán)境工程專業(yè)為省級卓越工程師計劃試點專業(yè)；微生物學被評為安徽省重點學科；《發(fā)酵工程與設備》和《生物化學》課程被評為省級精品課程，《微生物學》被評為院級精品課程。

 近5年來，我院承擔的科研項目有：國家自然科學基金項目1項，國家自然科學主任基金項目1項；科技部科技支撐項目1項；農(nóng)業(yè)部行業(yè)計劃項目1項，安徽高校自然科學研究項目16項，安徽省、合肥市各類科研項目30余項；產(chǎn)學研項目20余項。獲國家發(fā)明專利62項。主要研究領域涉及先進生物制造、仿生材料、酶學酶工程及應用、發(fā)酵理論研究及發(fā)酵工程技術開發(fā)、海洋天然產(chǎn)物研究、農(nóng)產(chǎn)品貯藏與加工、功能性食品研發(fā)、小漿果加工技術研究與產(chǎn)品開發(fā)、食品質(zhì)量控制與檢測、固體廢棄物（含農(nóng)業(yè)廢棄物）處理處置與資源化利用、水污染控制技術、環(huán)境微生物工程等。

 近3年來，我院在國內(nèi)國際等期刊公開發(fā)表科研論文80余篇，其中一類文章20余篇。獲安徽省科技進步三等獎2項，院級科研成果獎多項。

 我院還積極開展國際合作與交流活動。合作之初，德國方面就為“生物工程”本科專業(yè)提供了一系列成套的先進儀器設備，使我院在早期就完全具備本科專業(yè)辦學條件。2003年與德國、奧地利、泰國三國的高校共同申請了歐盟-亞洲鏈項目，2005年與德國Nelles教授博士共同申請德國技術合作公司/德國國際交流和發(fā)展中心（GTZ/CIM）項目、德意志學術交流中心（DAAD）項目等，以期為歐盟在中國的可持續(xù)資源化管理教育起到示范作用。在2006年以來已成功舉辦了七屆“亞歐環(huán)境技術與知識轉(zhuǎn)化”國際會議，產(chǎn)生了良好的學術影響。

 倡導和鼓勵大學生發(fā)展個性，積極參與科學研究、技術開發(fā)學科競賽、文學藝術創(chuàng)造及各類社會實踐活動，激發(fā)和培養(yǎng)大學生的創(chuàng)新精神、創(chuàng)業(yè)意識和科研基本能力，提高大學生人文素養(yǎng)、科學素養(yǎng)和藝術修養(yǎng)。2015年我院學子在安徽省第二屆大學生生物標本大賽一等獎；“以夢為馬”創(chuàng)業(yè)團隊在首屆安徽省“互聯(lián)網(wǎng)+”大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽中獲優(yōu)秀獎。2016年我院學子獲得“創(chuàng)青春·中國聯(lián)通”安徽省大學生創(chuàng)業(yè)大賽銀獎；安徽省第三屆大學生生物標本大賽二等獎；安徽省首屆大學生食品創(chuàng)新大賽一等獎、二等獎。2017年我院學子在第七屆“挑戰(zhàn)杯中國聯(lián)通”安徽省大學生課外學術科技作品賽奪得銀獎；另我院學生參與專利申報2項。2018年我院學子在第四屆全國“互聯(lián)網(wǎng)+”大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)大賽（青年紅色筑夢之旅專項賽道）獲得銅獎；奪得首屆全國大學生食品工程虛擬仿真大賽一等獎；榮獲2018年安徽省大學生生物標本制作大賽一等獎；摘得2018年安徽省大學生食品設計創(chuàng)新大賽一等獎。

我院是合肥學院最早承擔研究生培養(yǎng)的學院。環(huán)境工程碩士專業(yè)學位研究生始建于1980年開設的環(huán)境監(jiān)測本科專業(yè)，是安徽省最早、全國較早進行環(huán)境類本科教育單位；2005年在歐盟-亞洲鏈項目資助下，中、德、奧、泰四國高校在合肥學院開設環(huán)境工程本科專業(yè)，2011年環(huán)境工程專業(yè)被國務院學位委員會批準為首批服務國家特殊需求碩士專業(yè)學位研究生培養(yǎng)試點專業(yè)；2018年獲批碩士學位正式授權單位。目前該碩士點擁有4個省級工程技術研究中心，1個市級研究院-合肥環(huán)境工程研究院；1個院士工作站，1個博士后工作站，1個中德合作環(huán)境技術轉(zhuǎn)化中心；目前已培養(yǎng)畢業(yè)5屆研究生，5年科研經(jīng)費達2100余萬元，校內(nèi)碩導45人，校外導師50余人，學生整體就業(yè)質(zhì)量高。環(huán)境工程專業(yè)與韓國仁川大學、德國歐綠保集團及中科院過程研究所、中科院合肥物質(zhì)研究院都簽訂了協(xié)議，開展聯(lián)合培養(yǎng)研究生。