河北北方學院2003年設立藥學專業(yè)，2005年10月成立藥學系，隸屬原河北北方學院醫(yī)學院。2012年5月，隨著學校學科調整、機構改革，藥學系獨立建制，成為學校新的直屬系，科研、教學、人才培養(yǎng)等工作單獨管理。

藥學系擁有我校第一個省級重點學科，藥學專業(yè)2005年取得我校首批二級碩士學位授予權，2008年成為河北省“本科教育創(chuàng)新高地及品牌特色專業(yè)”，是河北省首批入選的國家級特色專業(yè)建設點。2010年取得碩士學位一級學科授予權，實現(xiàn)了整個冀西北地區(qū)碩士學位一級學科授權點零的突破，使研究生培養(yǎng)能力進一步增強，碩士學位授權涵蓋藥理學、藥物化學、藥劑學、生藥學、藥物分析、微生物與生化藥學，以及臨床藥學等7個專業(yè)。2012年又新近成為河北省首批入選國家級的“專業(yè)綜合改革試點”。2015年神經藥理學實驗室被評為省級重點實驗室。2020年藥學專業(yè)入選國家級一流本科專業(yè)建設點。          

藥學系教師始終保持艱苦創(chuàng)業(yè)，與時俱進，開拓進取，無私奉獻，爭創(chuàng)一流的優(yōu)良傳統(tǒng)，歷經20多年的辛勤耕耘和精心建設，迅速成長，在教學、科研和人才培養(yǎng)諸方面都取得長足進步，實現(xiàn)了一次又一次階段性飛躍，綜合辦學實力優(yōu)勢凸顯，成為我校優(yōu)秀團隊的典型代表。

藥學系現(xiàn)有藥理學、藥物化學、藥物分析和藥劑學4個教研室，1個實驗中心（下設神經電生理學、行為藥理學、藥物代謝動力學、中藥有效成分篩選、藥物提取及含量分析檢測、細胞與分子生物學、藥物制劑學、病理形態(tài)學8個研究室），1個藥物研究所。

現(xiàn)有藥學、藥學（臨床藥學方向）、藥物制劑、制藥工程4個本科專業(yè)及專業(yè)方向。

現(xiàn)有教職人員33人，其中教授、副教授14人，講師10人；碩士研究生導師9人，具有博士、碩士學位教師占全體教師的97%。有多人先后赴日本、加拿大、美國等國家訪問學習。

藥學系辦學特色鮮明，科研實力雄厚。近年來，主持、承擔并完成國家、省、市等各級科研課題40多項，在國內外核心期刊或重要國際會議上發(fā)表高質量專業(yè)論文200多篇，獲得科技成果和技術專利10余項，省、市科技進步獎十余項，主編、參編教材專著30余部；本科生參與國家自然基金、省部級等各類課題研究10余項，在國內外專業(yè)學術期刊或學術會議上發(fā)表高水平科研論文40余篇，并多次在全國大學生“挑戰(zhàn)杯”大賽中獲獎。

藥學系各專業(yè)一直致力于精英教育，注重學風建設，實施“導師制”，師生“一對一”結對，針對學生各自特點因材施教，從專業(yè)、學習、生活多方面給予指導；更注重實踐能力培養(yǎng)，低年級進課題組接受科研訓練、野外采藥實訓、制藥企業(yè)踐習，全方位培養(yǎng)學生的綜合能力。

藥學系實習實訓基地建設充分利用緊鄰京津晉的地區(qū)優(yōu)勢，選取管理嚴格的中國人民解放軍309、304、空軍總醫(yī)院、軍區(qū)藥檢所等部隊院所，宜昌人福藥業(yè)、河北石藥集團有限公司、神威藥業(yè)等制藥企業(yè)，以及秦皇島第一醫(yī)院、河北醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院等地方醫(yī)療機構，共計22個。10余家實習基地還為學生建立了就業(yè)“綠色通道”，實習優(yōu)秀即可留職工作。

藥學系本科生繼續(xù)研究生教育和就業(yè)形勢良好，考研率和就業(yè)率連續(xù)多年保持領先。學生畢業(yè)后主要在藥品生產和流通企業(yè)、醫(yī)藥院校、各級醫(yī)療機構、藥品檢驗所、科研院所、藥事管理部門等單位從事藥學相關的科學研究、教育教學、技術指導、產品研發(fā)、質量控制、藥事管理、工程設計、科技服務等相關工作。每年都有多名應屆畢業(yè)生考入沈陽藥科大學、第四軍醫(yī)大學、天津醫(yī)科大學、天津中醫(yī)藥大學等知名大學就讀研究生。