首都醫(yī)科大學生物醫(yī)學工程學院成立于2001年，前身是1987年成立的生物醫(yī)學工程系，是全國最早開展生物醫(yī)學工程專業(yè)教育的單位之一。學院現(xiàn)有教職工91人，其中教授10人、副教授27人；博士生導師6人，碩士生導師16人；現(xiàn)有本科生200人，碩士生34人，博士生19人。 
    首都醫(yī)科大學生物醫(yī)學工程學科是北京市重點學科。學科特色是“以臨床工程學和康復工程學為主要內(nèi)容的醫(yī)學應用型工程學學科”。學科本著“幫醫(yī)學研究認識深化，助醫(yī)學服務水平提高”的發(fā)展理念，堅持“明確理念，優(yōu)配資源，凝練特色，協(xié)調(diào)發(fā)展”的建設(shè)原則，遵循“理工科學與生物醫(yī)學緊密結(jié)合，基礎(chǔ)研究與醫(yī)學實踐緊密結(jié)合”的建設(shè)策略。學院是中國生物醫(yī)學工程學會理事單位、中國生物醫(yī)學工程學會醫(yī)學物理分會的副理事長和掛靠單位、中國生物醫(yī)學工程學會生物力學專業(yè)委員會委員單位、中華醫(yī)學會醫(yī)學工程學分會主任委員及掛靠單位、中國圖像圖形學會醫(yī)學影像專業(yè)委員會副主任委員單位、北京生物醫(yī)學工程學會副理事長單位、教育部生物醫(yī)學工程、計算機、醫(yī)學基礎(chǔ)教育教學指導委員會委員單位、教育部高等醫(yī)藥院?，F(xiàn)代教育技術(shù)與計算機教學指導委員會副主任委員單位、全國計算機基礎(chǔ)教育研究會醫(yī)學專業(yè)委員會主任委員和掛靠單位。 
    學院現(xiàn)有生物醫(yī)學工程（聽力學、醫(yī)學影像設(shè)備與技術(shù)、醫(yī)療器械工程技術(shù)管理等專業(yè)方向）、假肢矯形工程兩個本科專業(yè)，其中假肢矯形工程專業(yè)教育填補了國家本科教育空白。2008年生物醫(yī)學工程專業(yè)獲北京市品牌專業(yè)，北京市和國家特色專業(yè)稱號；2009年假肢矯形工程專業(yè)獲北京市特色專業(yè)稱號。學院除開展專業(yè)教育以外，還承擔著學校其他專業(yè)的本科、專科、研究生層次的理工類課程教學。學院具有一批高素質(zhì)教師，教師個人曾被評為全國優(yōu)秀教師、北京市優(yōu)秀教師、北京市教學名師、北京師德先進等。     
    在學科建設(shè)上，學院凝練并逐步穩(wěn)定了生物醫(yī)學工程二級學科方向。目前學院的優(yōu)勢學科為生物力學與康復工程學，其學術(shù)方向為組織器官生物力學現(xiàn)象與功能研究、人體康復器械工程學研究、人體生物物理現(xiàn)象與功能研究；重點建設(shè)學科為生物醫(yī)學儀器學，其學術(shù)方向為醫(yī)學儀器設(shè)計與信號處理方法研究、醫(yī)學影像處理與應用研究、激光醫(yī)療儀器設(shè)計與應用研究；教育必需學科為生物醫(yī)學信息學（數(shù)學、計算機），其學術(shù)方向為生物信息分析與應用研究、醫(yī)學信息處理與應用研究、生物系統(tǒng)數(shù)學建模與仿真；特色學科為臨床工程學，其學術(shù)方向為醫(yī)療儀器功能開發(fā)與應用研究、醫(yī)療設(shè)備風險與質(zhì)量控制、醫(yī)院信息處理系統(tǒng)設(shè)計與應用。 
   學院從早年的關(guān)幼波肝病中醫(yī)專家系統(tǒng)、基于神經(jīng)網(wǎng)絡的嗅覺和視覺的生物控制研究到現(xiàn)在的醫(yī)學圖像處理、數(shù)字化虛擬人體研究與應用、閉角型青光眼致盲機理和顱內(nèi)動脈瘤破裂風險的生物力學解釋、骨科治療技術(shù)與器械研究、生物信息學研究、血管與神經(jīng)的組織工程學研究、多傳感器測量系統(tǒng)的人體運動能量代謝、睡眠呼吸暫停機理及新治療方法的生物力學與計算機模型、激光醫(yī)療儀器設(shè)計與應用、拉曼光譜檢測技術(shù)醫(yī)學應用等研究工作，以及聽力學篩查與康復訓練裝置和適合中國國情的康復工程產(chǎn)品開發(fā)等研發(fā)工作均在生命過程認識和臨床診療與康復水平提高方面做出了貢獻。學院現(xiàn)有北京市科技創(chuàng)新團隊一個，北京市高層次人才資助一人。2005年以來，學院先后承擔歐盟合作項目2項、國家級自然科學基金19項，北京市自然科學基金11項，教育部項目2項、北京市教委項目17項，另有中科院開放課題、橫向課題、校級基礎(chǔ)臨床課題、首醫(yī)發(fā)展基金項目、校長基金項目等幾十項，總資助額近2000萬元。學院共發(fā)表SCI/EI/ISTP收錄文章158篇，核心期刊文章178篇。獲國家專利10項，軟件著作權(quán)47項。
   學院堅持引進與培養(yǎng)相結(jié)合，以培養(yǎng)為主的人才戰(zhàn)略，不斷優(yōu)化教育隊伍結(jié)構(gòu)，堅持把師德建設(shè)放在首要位置，以改善結(jié)構(gòu)和提升素質(zhì)為目標，以吸引、培養(yǎng)、用好為著力點，提高教師培訓針對性和實效性，努力構(gòu)筑人才高地。學院注重合作交流，組織國內(nèi)外專家高水平的學術(shù)報告，從外派訪問學者到短期進修，從參加高端會議到出訪交流，為學院教師開闊眼界，提高自身素質(zhì)水平，提供了良好的保障。
    首都醫(yī)科大學生物醫(yī)學工程學院已培養(yǎng)了千余名畢業(yè)生，他們基礎(chǔ)扎實、知識面廣、適應能力強，有良好的醫(yī)學背景和醫(yī)學應用能力，得到了用人單位的好評。學院已經(jīng)成為我國生物醫(yī)學工程高級人才培養(yǎng)的重要基地，是我國生物醫(yī)學工程學科發(fā)展與建設(shè)的重要力量。學院將立足首都，服務全國，面向世界，為建成 “國內(nèi)一流、國際知名”的生物醫(yī)學工程學科而不斷努力。